Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA1Q9UJY5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms