Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEFF2Q9UIK5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms