Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms