Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MLH3Q9UHC1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms