Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB6

LIMA1, LIM domain and actin-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMA1Q9UHB6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIMA1Q9UHB6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms