Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
APEX2Q9UBZ4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APEX2Q9UBZ4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms