Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms