Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD3Q9NYL9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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TMOD3Q9NYL9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD3Q9NYL9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
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