Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms