Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms