Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD8Q9NX08 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms