Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms