Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ASF1BQ9NVP2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms