Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC4BQ9NT99 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 333.6 ms