Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7BPQ9NSQ0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms