Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms