Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms