Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms