Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPOLBQ9NRJ5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms