Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms