Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms