Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NIT2Q9NQR4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms