Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC17Q9NP64 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms