Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRMS1Q9HCU9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms