Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC22Q9HCG8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms