Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC3GQ9HC16 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms