Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms