Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP3Q9H6T3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms