Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX6-2Q9C056 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX6-2Q9C056 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms