Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms