Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
PCGF6Q9BYE7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCGF6Q9BYE7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms