Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNHG12Q9BXW3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms