Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms