Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIOK2Q9BVS4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RIOK2Q9BVS4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RIOK2Q9BVS4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RIOK2Q9BVS4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms