Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms