Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBF4Q9BQW3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBF4Q9BQW3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms