Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms