Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms