Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKP4Q99569 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms