Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP88Q99567 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms