Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms