Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP2Q96SN8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms