Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KC1Q96S38 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms