Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms