Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms