Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms