Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC74BQ96LY2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms