Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms