Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms