Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms